百创S系列空间转录组细胞分割技术

产品简介

百创智造自主研发的BMKMANU S系列空间转录组芯片是国内首款基于微孔微珠的亚细胞级空间转录组产品,最高分辨率4.8μm ,并开创性的将组织原片H&E染色,原片荧光染色及原片高通量测序相结合进行精准的细胞分割,实现精准的单细胞级空间转录组测序,极大地推动了基础科研发展,目前在发育疾病、生理学疾病、胚胎发育、干细胞分化、绘制3D图谱、生殖健康、肿瘤等领域广泛应用。

百创S系列细胞分割技术原理:动物样本

百创智造S系列空间转录组细胞分割实现原理: 三图合一 百创智造基于S系列空间芯片的底层设计,开发出了自己的专利技术,可以得到完全没有错误的原片荧光图像以及H&E图像且与芯片完全对齐。基于荧光进行细胞核的定位刻画细胞核的边界;基于HE的校准辅助刻画细胞的边界,通过边界信息映射到芯片上,提取相应位置的测序数据,实现精准的单细胞分割。

百创S系列细胞分割技术案例

动物实验

百创S系列细胞分割技术原理:植物样本




相较于动物,植物细胞的形态和细胞大小差异巨大,若采取同一细胞尺寸预测分割,将导致分割结果较差;因此,为了更好的匹配植物样本特点,惠及植物领域的相关研究,百创智造针对植物细胞,采用了多尺度递进预测,结合百创智造训练的通用植物分割模型,可以在同一个植物组织贴片中,预测分割不同尺寸的细胞,极大的提高了植物细胞分割的准确性。

百创S系列细胞分割技术案例

植物实验

辅助软件

同时,百创智造提供免费的Windows可视化软件BSTCellViewer【百创智造官网免费下载】,可以结合百创智造植物多尺度分割流程输出的结果结合高清的原片明场图像进行手动细胞的修改,删减,圈定,得到更加精准的结果。
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