空间转录组
2024年4月17日
【原始数据下载】 物种信息：小鼠胚胎 空间芯片：BMKMANU S3000 测序策略：Illumina 测序数据量：1060G 下载链接：https://ngdc.cncb.ac.cn/search/ Prject_ID：CRA015748 【BSTMatrix 分析结果下载】 分析软件：BSTMatrix（下载链接：http://www.bmkmanu.com/portfolio/tools ） […]
2023年7月21日
该文件包含2个内容，1）原始数据的下载方式；2）已经使用BSTMatrix分析完成的结果文件下载方式 1.原始数据下载 物种信息：小鼠脑嗅球 测序策略：Illumina Novaseq 6000 测序数据量：101G 下载链接：https://ngdc.cncb.ac.cn/search/（Prject_ID：CRA011738） 2. BSTMatrix 分析结果下载 分析软件：BSTMatri […]
2023年7月5日
数据相关统计 表1 测序Reads统计 Type Number Percent(%) Number of Reads 1,338,426,735 Valid Barcodes 1,262,816,067 94.35 Valid UMIs 1,329,064,839 99.3 Final Valid Reads 1,262,615,019 94.34 表2 数据比对 Type Percen […]
2022年8月3日
python，版本3.8及以上，下载地址：https://www.python.org/downloads/ 相关模块：numpy，cv2，pandas，seaborn，sys，getopt R及Rstudio安装，下载地址：https://cran.r-project.org/ 相关R包安装：Seurat，dplyr，tibble，ggplot2 matrix.mtx.gz,genes.tsv. […]
2022年5月31日
图1、亚细胞级微孔空间芯片百创S1000 2022年4月20日百迈客百创智造研发的亚细胞定位空间转录组学芯片–百创S1000成功上市了，百创S1000空间转录组芯片是基于微孔微珠上Spatial barcode实现对组织切片上捕获的mRNA分子检测空间位置上基因表达技术，该技术将空间组学分辨率提高至5 μm，而国外主流芯片制造还处于100 μm的分辨率，标志着全面迈入国产化的空间转录组 […]