技术支持
2022年6月8日
操作步骤 1）将官网下载到的BSTViewer_project文件夹数据（或者通过运行BSTMatrix 得到的BSTViewer_project 文件夹）存放到英文命名的文件夹之中；【包括各个级别分辨率矩阵文件，及BMChiper 或者官网下载的HE 染色图片】可以同时在此文件夹下边新建一个outdir 作为文件输出路径； 2）运行“BSTViewer V3.0正式版-WIN-64\BSTVie […]
2022年6月8日
生成矩阵 1.1 软件环境依赖 A)python：版本8及以上，安装cv2模块（4.0以上版本），matplotlib，seaborn，pandas（1.5.0以上版本），tifffile，Cellpose，Pyyaml，scikit-image，tqdm B)Star：版本6.1d及以上版本 C)perl：threads及 threads::shared 模块 D)Rscript：需要以下 R […]
2017年2月3日
一、专有流程，扫描的3d无缝合原始数据 1、解压压缩包至本地 2、主程序为BMChiper.exe，双击打开（输出目录需要为英文，中文会发生报错） 二、通用流程，适合传入tif图，只使用裁剪和校准，不使用缝合功能 注：如果确定加载的he图像就是裁剪后的图像，则可以直接进行全图校准，不用再保存区域 相关链接：BMChiper 2.0软件使用说明