百创智造发布跨物种PBMC数据组,包含7个物种、14个样品!

BMKMANU S1000 小鼠睾丸 Demo数据结果展示
2023年5月5日
百创智造S系列空间转录组细胞分割Demo下载
2023年7月21日

百创DG1000单细胞PBMC数据组

2023开年,百创智造重磅发布7个物种(牡蛎,许氏平鮋,黄颡鱼,鳖,鸡,大鼠,人)共计14个样品的PBMC数据,涵盖了无脊椎,鱼类,爬行,禽类,哺乳动物多个类型的物种。这一发布成果是国产单细胞平台发布的成体系的免费PBMC数据,可供任何科研人员免费下载使用【数据下载链接见文末】。

百创智造DG1000跨物种PBMC数据

百创智造DG1000跨物种PBMC数据

外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)是外周血中具有单个核的细胞,包括淋巴细胞和单核细胞,是单细胞免疫相关研究的有效载体。

7种14个BMKMANU DG1000 PBMC单细胞数据t-SNE图

7种14个BMKMANU DG1000 PBMC单细胞数据t-SNE图

单细胞测序应用

单细胞mRNA测序技术(scRNA-seq)提供了单细胞水平的转录组研究,大大提高了对由多种细胞组成的器官或组织的研究“像素”,也迅速成为包括人类、动物和植物在内的各种研究不可替代的方法[1],帮助科研人员更好地了解器官或组织中的不同细胞类型、信号模式和发育过程等。

单细胞RNA测序技术的应用

单细胞RNA测序技术的应用

随着单细胞研究的发展,现在单细胞的研究不再局限于同一物种之中,越来越多的研究也涉及多个物种。


2019年,Cell期刊上的一项研究收集了18个进化距离较远物种的脑组织进行了单细胞转录组测序[2]。研究者发现,小胶质细胞表达从啮齿类动物到人类的同源基因的保守核心基因程序,包括与胶质细胞和神经元之间相互作用相关的受体和配体。

进化远端动物小胶质细胞形态的定量分析

进化远端动物小胶质细胞形态的定量分析

2022年5月,为了确定不同物种间的肠道保守性,研究人员收集了小鼠、大鼠、猪、猕猴和人类的回肠组织,随后进行了scRNA-seq分析[3]。

跨物种回肠上皮的保守细胞类型和功能

跨物种回肠上皮的保守细胞类型和功能

2013年“单细胞测序技术”被Nature杂志评为“年度技术,2019年的年度技术则为“单细胞多组学”。近年来,基于高通量单细胞测序技术的课题研究可谓热火朝天。单细胞转录组的平台虽然有很多,但目前主流的商业化单细胞测序技术(包括仪器,耗材等)还是处于国外企业掌控的局面,科研成本居高不下。

为了突破单细胞试剂耗材及仪器长期以来的国外技术垄断,降低单细胞应用的成本,让单细胞技术能够惠及更多的科研群体,经过多年潜心研发,百创智造于2022年5月底发布了创新研发的单细胞微液滴平台-百创DG1000。

百创DG1000单细胞平台

百创DG1000单细胞平台

2022年4月,百创智造发布了时空组学另外一个重要的组成部分,空间转录组产品——基于微孔微珠的亚细胞级分辨率空间转录芯片BMKMANU S1000。

百创S1000空间转录组

百创S1000空间转录组

百创智造PBMC数据组下载链接:https://pan.baidu.com/s/17Yw3j7eZHEXjADKSUNXGIw
提取码:BMKM

参考文献

[1] Jovic, Dragomirka et al. “Single-cell RNA sequencing technologies and applications: A brief overview.” Clinical and translational medicine vol. 12,3 (2022): e694. doi:10.1002/ctm2.694

[2] Geirsdottir, Laufey et al. “Cross-Species Single-Cell Analysis Reveals Divergence of the Primate Microglia Program.” Cell vol. 179,7 (2019): 1609-1622.e16. doi:10.1016/j.cell.2019.11.010

[3] Li, Haonan et al. “Cross-species single-cell transcriptomic analysis reveals divergence of cell composition and functions in mammalian ileum epithelium.” Cell regeneration (London, England) vol. 11,1 19. 5 May. 2022, doi:10.1186/s13619-022-00118-7

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