新品上线 | 百创DG1000单细胞转录组测序重磅来袭

百迈客生物经过多年技术沉淀，发布了其创新研发的单细胞微液滴系统—百创DG1000。正如中国科学院水生生物研究所何舜平研究员在百创DG1000发布会上提到的，单细胞测序是基因测序的创新性技术，其由于建库成本较高也是该技术不能走进普通实验室障碍，百创DG1000则很大程度上解决了单细胞测序成本高的问题，将会大大提升科研成果产出，让单细胞技术能够惠及更多的科研群体。

百创DG1000单细胞转录组测序技术介绍

百创DG1000利用微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术来实现高通量的细胞捕获，可以在短时间内完成油包水的过程，形成乳浊液，快速实现1~8个样本的灵活上机，完成单细胞测序文库构建，可应用于细胞图谱构建、肿瘤异质性、神经科学、免疫感染、胁迫应激、生物进化等方向，将成为临床医学和基础科学研究中强有力的工具。

百创DG1000单细胞全流程服务

  百迈客提供从研究方案制定、单细胞悬液制备、单细胞分选、建库测序、生物信息分析、定制化分析、生信培训班的单细胞全流程解决方案，助力科研工作者以高通量、低成本开展单细胞转录组研究。

图1、百创DG1000单细胞转录组测序实验流程示意图

技术优势

送样要求

• 样本类型

1）组织样品：新鲜组织（约200mg）从活体取下后，去除周围的脂肪、结缔组织或者坏死组织，用预冷的PBS或者生理盐水冲洗干净，直接或者放在组织保存液中快速转移到解离实验室进行单细胞悬液制备；

2）血液样品：取2-3mL新鲜血液迅速置于EDTA抗凝紫色中保存，4℃（一般不超过12h）转移或者寄送到百迈客实验室，分离PBMC后进行上机；或者密度梯度离心分选出PBMC，加入细胞冻存液梯度冻存，干冰运输；

3）新鲜冷冻样本（单细胞核转录组）：新鲜组织清洗干净放入冻存管中，液氮中速冻，-80℃保存，最后干冰运输；

• 单细胞悬液要求

细胞数量大于5×105个、活细胞率大于85%、细胞直径小于60μm 、结团率：<15%，少碎片，不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子等。

应用场景

单细胞测序技术的应用，将细胞类型与细胞命运、状态和功能相关联，促进了发育生物学、肿瘤学、神经科学、免疫感染、胁迫应激等研究领域的发展。

• 图谱绘制

通过绘制不同物种/组织/疾病/细胞亚型的单细胞图谱，确定所有细胞类型中的基因表达模式，鉴定特异maker genes，202203在Science发表的Fly Cell Atlas: a single-nucleus transcriptomic atlas of the adult fruit fly[1]，对果蝇的15种组织类型，63个样本，共58万个细胞核进行了单细胞转录组分析，构建了全面的果蝇细胞图谱；

• 生长发育过程

研究种子萌发、胚胎发育、器官形成、组织再生，及肿瘤/疾病进展等发育分化过程，揭示不同类型细胞发育分化轨迹，202107在Nature发表的Molecular architecture of the developing mouse brain[2]，对小鼠7-18天的胚胎脑每天取样，获得215个胚胎，93个样本，共292,495个细胞，构建了发育过程中的小鼠大脑图谱；

• 疾病分子机理

探究肿瘤/疾病环境下细胞组成和基因表达的变化，研究免疫识别应答等免疫学问题，揭示肿瘤/疾病环境中不同类型细胞功能与疾病发生分子机制，202102在Cell上发表的A pan-cancer single-cell transcriptional atlas of tumor infiltrating myeloid cells[3]，对194例患者的肿瘤、癌旁组织、外周血、淋巴结，338个样本，共138,161个髓系细胞进行了单细胞转录组分析，探究了肿瘤关键调控因子肿瘤浸润髓系细胞的组成与临床因素的相关性。

图2 大规模单细胞图谱构建[1,2,3]

百创DG1000的出现，可以让大规模细胞图谱构建的门槛更低，让更多科研工作者可以享受前沿技术带来的红利

参考文献：

1. 李宏杰等。“蝇细胞图谱：成年果蝇的单核转录组图谱。” 科学（纽约，纽约）卷。375,6584（2022）：eabk2432。doi:10.1126/science.abk2432
2. 拉曼诺，焦勒等人。“发育中的小鼠大脑的分子结构。” 自然卷。596,7870（2021）：92-96。doi:10.1038/s41586-021-03775-x
3.  程思金等。“肿瘤浸润骨髓细胞的泛癌单细胞转录图谱。” 细胞卷。184,3（2021）：792-809.e23。doi:10.1016/j.cell.2021.01.010